Patologinė anatomija – mokslo šaka, tirianti dėl ligos atsiradusius organizmo ląstelių, audinių ir organų pokyčius. Bendroji patologinė anatomija tiria tipinių patologinių procesų (kraujo, limfos, medžiagų apykaitos sutrikimų) morfologiją. Specialioji patologinė anatomija tiria ligų ir sindromų esmę, etiologiją, patogenezę, morfogenezę, eigą, komplikacijas ir mirties priežastis. Svarbiausieji tyrimo metodai – lavonų skrodimas (autopsija) ir iš gyvo žmogaus paimto audinio gabaliuko išpjovimas (biopsija).