Morfogenezė – biologinis organizmų organų, sistemų ir kūno dalių atsiradimas bei jų raida kaip  individualaus (ontogenezės) taip ir evoliucinio (filogenezės) vystymosi metu. Morfogenezės ypatumų tyrimai padeda nustatyti organizmų evoliuciją, paveldimumo dėsningumus ir kt.