Heteroatomas – organinėje chemijoje: bet koks junginio atomas, esantis organinio junginio molekulės žiede, kuris nėra anglies arba vandenilio atomas. Termino naudojimas grindžiamas tuo, kad organinis junginys turi turėti nors viena C-H ryšį, o kitų elementų atomai yra laikomi kitais, papildomais. Šis terminas vartojamas labiau siauresnėje sampratoje, kai heteroatomas pagrindinėje grandinėje (molekulės struktūroje) pakeičia anglį. Pagrinde heteroatomais būna deguonis, azotas, siera, fosforas ir halogenai (chloras, bromas, jodas). Šis terminas sutinkamas ir biochemijoje, kur jis reiškia atomą, kuris priklauso molekulei-kofaktoriui, o ne pagrindinei polimerinei grandžiai.