Anatoksinai (gr. ana – panašiai kaip + toxikon – nuodai; sinonimas – toksoidai) – imunogeninės ir antigeninės medžiagos, gaunamos iš kai kurių biologinės kilmės nuodų (pvz., bakterijų, egzotoksinų, kuriuos išskiria gyvi mikroorganizmai), panaikinus arba labai susilpninus jų kenksmingumą. Vartojami skiepyti nuo stabligės, difterijos, ir kitų ligų, antitoksiniams serumams gauti.